При установке i3 и подобных оконных менеджеров, где устанавливается dmenu внешний вид уведомлений становится мягко говоря не очень красивым. Темы из настроек Xfce не меняются, иконки в уведомлении нет.
Причиной тому служит dunst, который выводит все OSD уведомления.
Все решается очень просто - нужно удалить пакет dunst
sudo apt-get purge dunst