При установке i3 и подобных оконных менеджеров, где устанавливается dmenu внешний вид уведомлений становится мягко говоря не очень красивым. Темы из настроек Xfce не меняются, иконки в уведомлении нет.

Причиной тому служит dunst, который выводит все OSD уведомления.

Все решается очень просто - нужно удалить пакет dunst

sudo apt-get purge dunst